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DELiVR:一种基于深度学习的虚拟现实支持的cFos推断流程

by AIBackup

DELiVR,是一款基于深度学习的cFos推断流程,它利用虚拟现实技术进行注释,提供了一种更准确、更快速的大脑细胞分析方法。该工具不需要编程技能,用户可以通过Fiji插件轻松使用。

DELiVR的出现是对大脑细胞分析的一次革新。它结合了组织清晰、光片显微镜、虚拟现实注释和深度学习,形成了一个强大的深度学习流程,用于在整个大脑中映射cFos+细胞。它以易于使用的FIJI插件和docker容器的形式提供。

该工具的虚拟现实优势在于,它可以提高注释的准确性,同时加快了注释的速度,平均提高了7倍。DELiVR的方法在过滤和阈值分割技术方面表现出色,实例Dice达到79.18%,实例敏感性达到84.70%,表现出色。

DELiVR还能产生原始图像和图谱空间的全脑分割输出。细胞被赋予与Allen Brain Atlas的Area ID匹配的值,使得基于大脑区域的颜色编码成为可能。

通过docker和Fiji插件,DELiVR可以在从个人电脑到集群的任何设备上运行,为研究人员创建了无缝的工作流程。只需插入原始数据和输出位置即可。

使用DELiVR,研究人员探索了肿瘤患者的大脑活动,包括体重稳定的鼠类和与癌症相关的体重减轻的鼠类。结果揭示了与癌症相关的体重控制的神经生理表型的深入见解。

总的来说,DELiVR是一种用于分析健康和疾病状态下小鼠大脑中神经活动标记的虚拟现实训练、深度学习流程。此外,它对用户友好,配有易于启动的FIJI插件。

DELiVR不仅是神经科学家的工具,它为将虚拟现实集成到AI训练数据的注释中提供了蓝图,从而在机器学习的关键步骤中实现了革新。

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