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深度学习引领抗生素新发现:针对多重耐药菌Acinetobacter baumannii的有效攻击

by AIBackup

在抗生素研发领域,深度学习技术正在发挥越来越重要的作用。最近发表在《自然化学生物学》上的一项研究,利用先进的机器学习算法,筛选出一种名为abaucin的化合物,该化合物能有效针对多重耐药菌Acinetobacter baumannii。这种菌在医院中常见,对大多数抗生素产生了抗药性。

研究人员使用了一种名为消息传递神经网络的模型,该模型通过迭代地交换原子周围的化学环境信息,将分子的图形表示转化为连续的向量表示。通过累积各种局部化学区域的向量表示,模型获取了整个化合物的全面表示。为了增强学习特征,研究人员使用RDKit计算了固定的分子特征。最后,将学习到的特征和计算出的特征合并,作为前馈神经网络的输入,训练模型预测分子的抗菌性质。

通过这种方法,研究人员筛选了大约7500种分子,找出了那些能抑制A. baumannii在实验室测试中的生长的分子,然后构建了一个预测性的机器学习模型,最终发现了新的潜在抗生素abaucin

abaucin不仅展示了作为潜在抗生素的有希望的特性,而且还表现出对A. baumannii的选择性活性,使其成为一种狭谱抗生素,对其他细菌种类的影响最小。这种特异性对于最小化对人体自然微生物群的干扰至关重要,因为这些微生物在人体健康中起着重要的作用。更令人鼓舞的是,研究报告指出,abaucin在小鼠伤口模型中有效地控制了A. baumannii感染,显示出其治疗潜力

这项研究强调了机器学习在现代科学研究中的价值,特别是在生物学和抗生素发现领域,这些领域与临床应用密切相关。通过利用其快速分析大量化学数据集的能力,机器学习使研究人员能更有效地识别具有针对性抗菌性质的分子。这种方法不仅加速了药物发现过程,而且增加了找到对抗高度耐药菌如A. baumannii的有效化合物的可能性。

机器学习在这项研究中的成功为抗生素研究的未来开辟了令人兴奋的可能性。随着先进算法和计算模型的不断发展,科学家可以优化识别结构多样和功能独特的抗菌引物的过程。通过利用人工智能的力量,我们可能离克服抗生素抗药性的全球挑战更近了一步

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